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    重磅发布 | Xenium单细胞分辨率赋能肿瘤空间组学研究

    上传者:兰卫医学
    时间:2024-01-19
    浏览量:1436
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    Xenium单细胞分辨率

    赋能肿瘤空间组学研究

    上海兰卫医学检验所股份有限公司(以下简称“兰卫医学”)秉承科研创新和勇于争先的精神,与10x Genomics公司合作建立了高水平示范实验室,配置了先进的科研设备,为临床科研提供单细胞转录组测序、空间转录组测序(Visium平台)和基于原位杂交技术的空间转录组(Xenium平台)检测服务。

    2024年1月16日,Xenium技术平台第一批实验样本检测数据正式下机,质控完全合格,在上海率先高质量高效率完成交付检测和数据分析。该项目基于研究者对“肿瘤-分子病理-单细胞/亚细胞分辨率空间组学”层层递进的研究构思,确定各种类型细胞的空间定位、比例和分布特征,逐步将target bio-marker定位在单细胞,为佐证研究者的idea提供了高水准、信息化和可视化的结果与证据。

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    图1:肿瘤病理标注

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    图2:Xenium数据概览

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    图3:Xenium将光学特征解码为转录本表达,采集并形成图像


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    图4-1:利用DAPI对细胞核染色,结合深度学习方法推断完整的细胞边界

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    图4-2:利用DAPI对细胞核染色,结合深度学习方法推断完整的细胞边界


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    图5:将转录本分配给细胞


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    图6-1:实现单细胞/亚细胞分辨率的空间转录组分析,绿点-EPCAM , 蓝点-KLRD1 ,粉红点-LILRB2


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    图6-2:实现单细胞/亚细胞分辨率的空间转录组分析,绿点-EPCAM转录本


    Xenium 具备简单快速的工作流程

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    兰卫医学单细胞转录组测序

    与空间组学技术平台


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    目前,兰卫医学单细胞转录组测序与空间组学三大平台已承接多个三级医院临床与科研专家的项目,服务涉及北京、上海、广东和江西等多个区域。兰卫医学将持续联合肿瘤专家、分子病理专家、生信专家/团队和厂商专家,凝心聚力为客户提供高质量、高效率和可信赖的科研服务。


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